imagen: Caracol Yap (YHS) en el sitio a 6.903 m (arriba) y después de la captura (abajo). Escena Más
Crédito: Mu Y et al. PLOS Genetics, 2021
Una nueva secuencia completa del genoma del pez caracol Yap hadal proporciona información sobre cómo los peces inusuales sobreviven en algunas de las partes más profundas del océano. Xinhua Chen de la Universidad de Agricultura y Silvicultura de Fujian y Kyung Shi de la Academia de Ciencias Marinas BGI publicaron su análisis del nuevo genoma el 13 de mayo en la revista. PLOS Genetics.
Los animales que viven en ambientes de aguas profundas enfrentan muchos desafíos, que incluyen altas presiones, bajas temperaturas, poca comida y casi ninguna luz. Los peces son los únicos animales vertebrales que viven en la región de Hadal, definida como profundidades de menos de 6.000 metros, y las espirales de Hadal viven en al menos cinco trincheras separadas. Chen, Shi y sus colegas construyeron una secuencia completa y de alta calidad del genoma del pez espiral Yap Hadal para comprender cómo se ha adaptado a la vida en las profundidades marinas. El pez fue capturado en la Fosa de Yap en el Océano Pacífico occidental a una profundidad de unos 7000 metros.
El análisis del nuevo genoma reveló múltiples adaptaciones para vivir en un ambiente frío, oscuro y de alta presión. El pez caracol transporta genes de reparación del ADN adicionales, que pueden ayudar a mantener intacto su genoma en condiciones de mucho estrés. También tiene cinco copias de un gen enzimático que toma un compuesto producido por bacterias en su intestino y lo convierte en un compuesto que estabiliza la estructura de las proteínas bajo alta presión hidrostática. El pez caracol también perdió ciertos genes asociados con la visión, el gusto y el olfato, que probablemente serían innecesarios en su entorno oscuro y restringido en alimentos.
Estos nuevos hallazgos proporcionan pistas sobre los mecanismos que han desarrollado los caracoles para sobrevivir en las fosas oceánicas. Sin embargo, los investigadores indican que se necesitarán más estudios para confirmar las funciones de estos cambios genéticos. Además, la secuenciación del genoma de alta calidad podría ser un recurso para futuras investigaciones en profundidad de los peces caracoles y otros animales que viven en la región del muérdago.
«Varios genes asociados con la reparación del ADN muestran evidencia de selección positiva y el número de copias ha aumentado en el genoma del pez caracol Yap hadal, probablemente reflejando la dificultad de mantener la integridad del ADN bajo alta presión hidrostática. Las cinco copias de N-trimetilamina», agrega Chen. Óxido (TMAO): un generador de enzimas flavinasas que contiene monooxigenasa-3 (fmo3) y abundancia de bacterias trimetilamina (TMA) en el intestino del pez caracol Yap hadal podría proporcionar suficiente TMAO para mejorar la estabilidad de las proteínas en condiciones abisales «.
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Estudio piloto de revisión por pares; los animales
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Cita: Mu Y, Bian C, Liu R, Wang Y, Shao G, Li J, et al. (2021) La secuenciación completa del genoma del pez caracol de la fosa de Yap (~ 7000 d.C.) ilustra los mecanismos moleculares que subyacen a la adaptación en aguas profundas. PLoS Genet 17 (5): e1009530. https: /
Financiamiento: este trabajo fue apoyado por subvenciones del Programa Nacional de Investigación y Desarrollo Clave en China (2018YFD0900602; https: /
Intereses en competencia: los autores afirman que no existen intereses en competencia.
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